生態系統的結構包括生態系統的成分和營養結構，營養結構即食物鏈和食物網，生態系統的成分則包括非生物的物質和能量、生產者、消費者和分解者。
生態系統是由生物與非生物相互作用結合而成的結構有序的系統。生態系統的結構主要指構成生態諸要素及其量比關系，各組分在時間、空間上的分布，以及各組分間能量、物質、信息流的途徑與傳遞關系。生態系統結構主要包括組分結構、時空結構和營養結構三個方面。
（一）非生物物質：空氣、水、礦物質等
（二）非生物能量：陽光、熱能
（三）生產者：自養型生物，綠色植物
（四）消費者：初級消費者→次級消費者→三級消費者，屬異養型生物
（五）分解者：主要是異養型、營腐生生活的微生物（另外還有少量腐生動物）