1.復旦大學邯鄲路校區
地址：邯鄲路220號。邯鄲校區或邯鄲路校區，是復旦大學的主校區，通稱“本部”(廣義上的本部)，因位于邯鄲路220號而得名。校區在楊浦區，靠近五角場。1922年私立復旦大學的大學部從徐家匯李公祠(今上海市復旦中學)遷入。1952年院系調整后，邯鄲校區校園逐漸向東、向南擴展。現在邯鄲校區占地922297平方米，合1383畝，分為東、南、北、中四個地區。
2.復旦大學楓林校區
地址：醫學院路138號。復旦大學楓林校區是復旦大學的四大校區之一，俗稱醫學院校區，位于繁華的徐家匯東側。楓林校區因所在地徐匯區楓林橋地區而得名。楓林校區是原上海醫科大學的校址，占地288畝，是復旦大學除藥學院外各醫學院系的所在地，包括基礎醫學院、公共衛生學院和護理學院。因東安路(原東廟橋路)穿越校區，楓林校區被分為東苑和西苑，此外護理學院單獨位于楓林路305號。
3.復旦大學桃仙張江校區
地址：張衡路825號。張江校區是由復旦大學出資 ，上海張江(集團)有限公司出地共同建設的項目，在張江高科技園區建設“以研究和應用為主，面向產業，相對集中，資源共享”的高等教育大學校區，也是我國著名高校與國家級高科技園區聯合打造上海“產學研”高地。
4.復旦大學大連新江灣城新校區
地址：淞滬路2500號。復旦大學始創于1905年，原名復旦公學，1917年定名為復旦大學。上海醫科大學前身是1927年創辦的國立第四中山大學醫學院，1932年定名為上海醫學院，1985年改名為上海醫科大學。2000年，復旦大學與上海醫科大學合并，組建新的復旦大學，進一步拓寬學科格局，增強辦學實力，已經發展成為一所擁有哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、醫學、管理學、藝術學等11個學科門類的綜合性研究型大學。