2、南京大學，于1994年被確定為國家211工程重點支持的大學。
3、東南大學，于1996年12月入選首批211工程重點建設高校。
4、河海大學。簡稱“河海”，位于江蘇省會南京市，是一所有百年辦學歷史，以水利為特色，工科為主，多學科協調發展的教育部直屬，教育部、水利部、國家海洋局與江蘇省人民政府共建的全國重點大學。
5、南京理工大學。簡稱“南理工”，位于古都南京市，北依紫金山，西臨明城墻，是一所隸屬于中華人民共和國工業和信息化部的全國重點大學，學校創建于1953年，前身是中國人民解放軍軍事工程學院炮兵工程系。
6、南京航空航天大學。是中華人民共和國工業和信息化部直屬的一所具有航空航天民航特色的理工類全國重點大學，由工業和信息化部、江蘇省人民政府、中國民用航空局共同建設。
7、南京師范大學。稱“南師大”，坐落于六朝古都南京市，由江蘇省人民政府和中華人民共和國教育部共建，是國家“211工程”重點建設高校、國家“雙一流”建設高校和江蘇高水平大學建設高校。
8、南京農業大學。是一所以農業和生命科學為優勢和特色，農、理、經、管、工、文、法學多學科協調發展的教育部直屬全國重點大學，是國家211工程重點建設大學和985優勢學科創新平臺高校之一。
9、中國藥科大學。是中華人民共和國教育部直屬的一所以藥學為特色的全國重點大學，是國家211工程，是中國首批具有博士、碩士學位授予權的高等學校。