學校源自1902年創辦的河南大學堂，先后經歷了河南高等學堂、河南高等學校、河南公立農業專門學校、國立第五中山大學農科、河南大學農學院等辦學階段。1952年全國院系調整時重新獨立建制，更名為河南農學院。1984年12月更名為河南農業大學。2009年9月成為農業部與地方省政府共建的第一所省屬農業高校。2012年11月成為國家林業局與省政府共建高校。2013年5月學校牽頭的河南糧食作物協同創新中心入選國家首批“2011計劃”。
學校建有鄭州市文化路、龍子湖和許昌新區三個校區，占地面積281.35萬㎡；學校下設20個學院，設有農、工、理、經、管、法、文、醫、教、藝10大學科門類；建有7個國際和國家研究平臺，70個省部級研究平臺；擁有1個一級學科國家重點學科，4個河南省優勢特色學科，19個省部級重點學科；7個博士后科研流動站；9個博士學位授權一級學科，18個碩士學位授權一級學科，9個碩士專業學位類別；79個本科專業。各類在校生3萬余人；在職教職員工2162人，其中博士學位865人。