生物遺體的保存條件：在高能的水動力環境下，生物遺體容易磨損。PH值小于7.8時，碳酸鈣組成的硬體容易遭溶解。氧化條件下有機質易腐爛，在還原條件下容易保存下來。此外，還會受到生活著的動物吞食、細菌腐蝕等因素的影響。
時間因素：生物死后迅速埋藏才有可能保存為化石。長期埋藏并發生石化作用才能保存為化石。
埋藏條件：生物死后因被不同的沉積物質所掩埋，保存為化石的可能性會有差別。如果生物遺體被化學沉積物、生物成因的沉積物所掩埋，硬體部分易保存。但若被粗碎屑物質埋藏，由于機械作用容易被破壞。在特殊條件下，松脂的包裹或凍土的埋藏，可以保存完好的化石。
成巖作用的條件：沉積物在固結成巖過程中，壓實作用和結晶作用都會影響石化作用和化石的保存。在碎屑巖中的化石很少能保持原始的立體形態，而化學沉積物在成巖中的重結晶作用，常使生物遺體的細微結構遭受破壞。